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生物多樣性信息資源. I. 物種分布、編目、系統(tǒng)發(fā)育與生活史性狀

媒體:生物多樣性雜志  作者:王昕、張健等
專業(yè)號:龍春萍 2020/3/1 8:29:58

物種是生物多樣性研究的基本單位(洪德元, 2016)。世界上有多少個物種存在、物種是怎樣起源的、各個物種是如何分布的、它們的分布范圍在過去、現(xiàn)在和未來是怎樣變化的等是生物多樣性研究的基本問題(Brown, 1995;Hortal et al, 2015)?;卮疬@些問題依賴于大范圍的、高質(zhì)量的關于物種分布、編目、系統(tǒng)發(fā)育與生活史性狀等方面的數(shù)據(jù)。關于這些數(shù)據(jù)的收集,至少可以追溯到林奈、達爾文、華萊士、洪堡等。然而,這些數(shù)據(jù)大多零散地分布在標本館、博物館、書籍、研究報告和研究論文中。近年來,隨著生物多樣性信息學(BiodiversityInformatics)的蓬勃發(fā)展(Soberón & Peterson, 2004; 馬克平, 2014; 張健, 2017),大量的開放數(shù)據(jù)庫和論文數(shù)據(jù)存儲機構(gòu)應運而生。大量的數(shù)據(jù)資源,通過新的處理模式,在科學的進步和信息資源管理方面,呈現(xiàn)出前所未有的機遇,為這些數(shù)據(jù)的整理、標準化、共享和深入挖掘等提供了可能(Hampton et al,2013; 張健, 2017)。

 

圖為航拍的天童植物景觀(胡健波提供)

 

生物多樣性數(shù)據(jù)的大量涌現(xiàn)和數(shù)字化一方面為生物多樣性研究者提供了諸多機遇,有助于我們深入地研究物種起源和進化、生物多樣性維持等理論問題,也有助于我們快速準確地應對瀕危物種保護、保護區(qū)管理等實踐問題(張健, 2017)。另一方面,也為生物多樣性研究帶來了很多挑戰(zhàn)。首先,這些數(shù)據(jù)資源零散地分布在不同的網(wǎng)絡平臺、研究論文等中,給研究人員的檢索和更新等帶來了極大的困難。第二,由于生物多樣性本身的復雜性,研究方法多種多樣,測量和記錄的信息在不同的研究中也千差萬別,這就導致大部分數(shù)據(jù)庫結(jié)構(gòu)復雜、變量繁多,個人很難在短期內(nèi)對數(shù)據(jù)庫有比較全面的了解,很有可能出現(xiàn)對數(shù)據(jù)庫的誤用和濫用。第三,這些零散的數(shù)據(jù)庫之間還存在很多的重復,導致研究人員花費很多時間和精力來反復瀏覽相同的內(nèi)容,或者不知道應該如何選擇適合自己研究問題的數(shù)據(jù)。綜上所述,如何高效選擇和有效利用這些海量的生物多樣性數(shù)據(jù)資源成為生態(tài)學家和保護生物學家在大數(shù)據(jù)時代面臨的一大難題。

面對生物多樣性數(shù)據(jù)庫資源零散分布的問題,本文把與物種有關的數(shù)據(jù)庫從物種分布、物種編目、系統(tǒng)發(fā)育和生活史性狀四個方面進行分類,并在其中選取一些有代表性的數(shù)據(jù)庫資源,對其發(fā)展歷程、使用情況、使用方法等進行簡要介紹。鑒于邵廣昭等(2014)已對海洋生物多樣性的信息資源進行了較全面的總結(jié),我們的介紹將主要集中在陸地生態(tài)系統(tǒng)。另外,生物多樣性的研究也離不開與之緊密聯(lián)系的環(huán)境要素,張鳳麟等(在審)對這方面進行了總結(jié)。通過這些關于生物多樣性相關數(shù)據(jù)資源的介紹,既可以為研究人員了解和使用這些數(shù)據(jù)庫提供橋梁和紐帶,也可以幫助我們了解生物多樣性信息學的進展與前沿,為我國相關領域的發(fā)展提供參考。

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